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Shiny用法整理（一）

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以下是最近整理的Shiny小程序的一些笔记

App formats and launching apps

曾经在写Shiny小程序的时候，需要包括2个文件:ui.R和server.R，里面分别包含了两个函数：shinyUI()和shinyServer()；但是现在的Shiny程序并不需要这样形式了，只需要一个app.R，格式跟我们平时在RStduio中写的shiny程序一样，由三部分组成，如下： ## app.R ##

ui <- fluidPage(
    ......
)

server <- function(input, output) {
    ......
}

shinyApp(ui = ui, server = server)

如果是在写代码的时候测试的话，出了用shinyApp外，还可以用

app <- shinyApp(ui, server)
runApp(app)

或者如果myapp文件夹下有shiny的小程序话，可以这样调用

runApp("myapp")

Custom Function

在写shiny的server部分时，不可避免会遇到一些自定义函数，这时可以选择如下：

func <- function(x){x + 1}
server <- function(input, output){
  res <- reactive({
    func(as.numeric(input$n))
  })
  output$text <- renderText({res()})
}

除了上述方式外，可以用将自定义函数直接写在reactive({})中，然后再计算输出，如：

server <- function(input, output){
  res <- reactive({
    as.numeric(input$n) + 1
  })
  output$text <- renderText({res()})
}

Stop reactions with isolate()

最基本的shiny程序是立即将observer传递给reactive expression，但是有时我们希望其是可控的，比如跟actionButton搭配，当点击actionButton才让reactive执行，这时可以考虑用isolate()了

使用isolate()来隔离reactive expression使其在没有点击actionButton前无法接受observer值，如例子如下：

server <- function(input, output) {
  output$distPlot <- renderPlot({

    # Take a dependency on input$goButton
    input$goButton

    # Use isolate() to avoid dependency on input$obs
    dist <- isolate(rnorm(input$obs))
    hist(dist)
  })
}

如果你不想在页面一开始就输出表格/图片等信息，可以用input$goButton == 0的if语句来控制（这种方法很好用的），并且isolate({})还可以用于控制reactive expressions，如下的fib()函数

output$nthValue <- renderText({
  if (input$goButton == 0)
    return()

  isolate({ fib(as.numeric(input$n)) })
})

Progress indicators

如果shiny程序将要执行一个优点耗时的计算过程时，可以考虑增加一个progress bar来告诉使用者shiny正在计算ing，蛮实用的一个工具

我之前是这样写的，如下：

server <- function(input, output){
  data <- reactive({
    data.frame(x=rnorm(10), y=rnorm(10))
  })

  output$table <- renderTable({
    input$goTable

    withProgress(message = "Try it：", value = 0, {
      n <- nrow(data())
      for (i in 1:n) {
        incProgress(1/n, detail = "Please wait...")
        Sys.sleep(0.25)
      }
    })
    data()
  })
}

这次看了其教程后发现还有一些功能更为好使的写法（更加简洁和便于理解）：

server <- function(input, output){
  data <- reactive({
    data.frame(x=rnorm(10), y=rnorm(10))
  })

  output$table <- renderTable({
    input$goTable

    # Create a Progress object
    progress <- shiny::Progress$new()
    # Make sure it closes when we exit this reactive, even if there's an error
    on.exit(progress$close())

    progress$set(message = "Try it：", value = 0)
    n <- nrow(data())
    for (i in 1:n) {
      progress$inc(1/n, detail = "Please wait...")
      Sys.sleep(0.2)
    }

    data()
  })
}

Render images in a Shiny app

如果想展示一些经过R作图后产生的图片，那么在shiny中是要用renderPlot()即可，这也是很常见的用法；但是如果想直接将一张图片传到shiny网页上，则需要考虑用其他方法了

我之前用renderPlot()后发现有问题，这次才知道要用renderImage才行，如：

output$image <- renderImage({
  if (is.null(input$picture))
    return(NULL)

  if (input$picture == "face") {
    return(list(
      src = "images/face.png",
      contentType = "image/png",
      alt = "Face"
    ))
  }

}, deleteFile = FALSE)

未完待续。。还有一些继续整理下

参考资料：
http://shiny.rstudio.com/articles/

本文出自于http://www.bioinfo-scrounger.com转载请注明出处

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